In de periode tot de opening van het nieuw ingerichte Rijksmuseum, op 13 april 2013, was Ynte Alkema werkzaam als Projectleider Museale Inrichting Rijksmuseum Amsterdam. Onder de werkzaamheden vielen het projectmanagement voor de ontwikkeling en realisatie van de objectvoorzieningen en de ontwikkeling en realisatie van de bewegwijzering.